亚丁风景区紧靠三江（金沙江、澜沧江、怒江）高山耸立，峡谷相间的典型的横断山脉搏地带区内，由于地形复杂，属大陋性季风高原气候，加之海拔相差较大，从河谷亚热带到高山寒带，横跨五个自然气候带，经长期演化，形成多种植被类型，从低到高，分别为干河谷灌丛—亚高山针叶林—高山冠丛草甸—高山流石滩稀疏植被等多种植被，具有高等植物1115种，有维管束植物121科，430属，其中蕨类植物20科，34属，103种，种子植物101科，
396属，1012种，区呢属国家二、三级保护植物有王龙蕨、扇蕨、扇核木。长苞冰杉、丽江铁杉、桃儿七、八角莲、四川牡丹、金铁锁等，特别是地狱谷中的情人树（铁杉、高山栎同根）勘称植物世界奇观。

     亚丁风景区野生动物约200余种，主要一高山动物，森林动物为主，由于该区为典型的横断山脉地带，区内属南方动物区系的有小熊猫、林麝、白臀鹿、牛羚等；属北方动物系的种类有狼、猞猁、岩羊、藏鼠兔等。景区内动物属国家一、二级保护动物的有牛羚、小熊猫、水鹿、白臀鹿、林麝、豹金猫、羚、斑羚、黑熊、短尾猴等。此处黄鼬、松鼠、灰尾兔、猪獾等分布数量较大。

     景区中属国家保护鸟类有：藏马鸡、金鸡、藏雪鸡等。属我国特产种有：花被噪鹛、橙枝噪鹛等；鱼类种类比较丰富，主要种类有四川裂腹鱼、短须裂腹鱼、厚唇裸唇鱼、松潘裸鱼秋、梭形高原鳅、斯氏高原鳅、黄石爬等。