在九寨沟的地表地理环境下，较强的蒸发作用、地下水溢出后压力的减小、地形陡变处水流流速的增大、特别是水生植物的光合作用对CO2的大量吸收，均有利于钙华的堆积。这钟“反向”的喀斯特景观，成为大自然的一大杰作。
九寨沟喀斯特溶蚀的主要表现是发育有规模客观的地下岩溶通道。例如：长海无地表出水口，日则沟、丹祖沟下段呈于谷，均证明有地下河存在。
湖泊群的形成
海子形成的最基本条件是要有能储水的洼地，而对于九寨沟中的“河中湖”来说，海子前端还需要有能阻水的堤埂。九寨沟海子的成因是复杂的，但几乎都摆脱不了喀斯特作用的影响。这表现在两个方面：一是洼地的形成常和沿谷底的溶蚀作用有关，在天鹅海、五花海、五彩池等许多海子底部都可见到溶蚀形成的漏斗状深坑；二是海子前端堤埂的形成多与钙华的不断堆积有关，如日则沟内及诺日朗以下各海子前端和内部状似白色卧龙的钙华堤。
古冰川对海子的形成也起了重要作用，在距今数万年的第四纪晚更新世冰期，九寨沟冰川到达的下限约在海拔2900m处。在则查洼沟，约在上季节海下口处；在日则沟约在原始森林附近。最典型的如长海，这表现在冰川对谷底刨蚀形成洼地，冰川前缘的砾石和砂泥堆积物构成了阻水的堤坝。
另外，在九寨沟内的峡谷段，沿陡峭的山坡常形成崩塌、滑坡、泥石流，由此造成的堵塞也有利于湖泊的形成。上季节海、熊猫海、五花海、镜海等许多湖泊的形成均受到这种作用的影响。
瀑布的成因
九寨沟由北向南沟而上，地势逐渐升高，如果顺河谷切一个纵断面来看，这种升高是呈阶梯状的。这是因为在青藏高原的强烈上升中，其边缘形成了不同级别的阶梯状断块，这些断块在九寨沟主要一北西西走向的新构造断裂为界，九寨沟的主要瀑布如树正、诺日朗、珍珠滩、熊猫海等，正是发育在这些断层造成的地形阶坎上。由于在阶坎处形成跌水，水流内部压力减小，有利于水中CO2的逸出，促进了钙华的沉淀，使得钙华在阶坎跌水处不断的堆积生长，形成壮观的钙华.
水色五彩斑斓的原因
湖水色彩的起因，主要源于湖水对太阳光的散射、反射和吸收。太阳光或自然光是刹煌ǔさ牡ド庾楹隙傻母瓷猓诠馄字校珊旃庵磷瞎猓ǔぶ鸾ゼ跣 ＞耪档暮氏盅蘩龅睦堵躺得骱卸滩ǔさ纳⑸湓洞笥诔げǔぃ饩褪侨鹄⑸洌≧AYLEIGHSCATTERING）效应。瑞利散射效应在九寨沟的湖水中之所以尤为突出，主要是因沟内植被郁闭度高、水循环条件较畅通以及石灰华对悬移质的固定作用，从而使水中悬浮物、有机物、浮游生物极少，
湖水的洁净度和透明度极高。湖水中常见的CA2+、MG2+，HCO3-等离子也有增强短波光散射的作用。同时由于湖水透明度高，湖底的灰白色钙华、黄绿色藻类对透射光的选择性吸收和反射，也增加了湖水色彩的层次和变化。另外，九寨沟的湖泊处于地形起伏很大的深切峡谷中，不同地段同一时间、同一地段不同时间，太阳光的入射角及入射量、湖水表面对光的反射状况和湖水的透明度都有很大的变化，因此也造成了湖水色彩的更加变幻多姿。 |
