清真寺是阿訇、伊玛目等宗教人员处理坊内事物的办公处所，清真寺一般都没有阿訇或掌教伊玛目的宿舍，他们的家眷通常不信在寺内，教坊内如有公共事宜要办，如选聘阿訇、修寺、办学、过节等，阿訇、三掌教及管事乡老们要在寺内开会商议；穆斯林之间发生纠纷，往往也要到寺里来评断是非曲直。甚至有些地区的穆斯林生病，也要到清真寺求医，由阿訇念平安经、作“都阿”（祈祷、写“都阿”（祈祷词），进行精神治疗。

    清真寺不这是穆斯林锻炼身体的场所。中国穆斯林素有习武学拳的传统，保定清真寺后院便是附近回族练习摔跤和武术的场所，齐鲁一带的山东穆斯林，无论在城市还是在农村，人们都可以见到他们以清真寺为中心训练场所，习武弄棒，锻炼身体。训练他们的武术教练，有的是素孚众望的阿訇，有的是信仰虔诚的乡老。如山东益都（青州）城关的两座清真寺内，都有武术场子，其中东关寺的武术教练是当时的在任阿訇米成起。又如济南清真寺内，历史上也曾设有武术场，在那里任教练的是著名乡老左双臣、陈宝平、李毓琛等人，时至今日山东穆斯林还保持着这个传统。阳谷县张秋镇清真寺阿訇武贵祥，十几年如一日，坚持在寺内办少年儿童业佘武术学校，培养学员300多名，被评为全国少年儿童业佘体育学校的优秀练员。

    清真寺在历史上也曾是动员、组织穆斯林群众反压迫、反侵略的战斗指挥部，制造和储存军械旗帜的兵工厂、弹药库。中国穆斯林同其他兄弟民族一样，富有反对封建压迫的革命传统。元末有大量穆斯林参加了朱元璋领导的农民起义军，在推翻元王朝的斗争中立下了丰功伟绩。明末又有“老回回”马守应奋起抗明，对腐朽没落的明王朝给予了沉重的打击。有清代，全国各地的穆斯林更是斩木为兵，削秆为旗，发动了一次又一次的起义，与反动的清王朝进行了浴血的战斗。在这一次又一次的战斗中，清真寺成了起义穆斯林的指挥部、兵工厂和弹药库。许多阿訇就是起义群众的军事领袖。据杨毓秀《平回志》卷1记载，咸丰七、八年（1857、1858）赫明堂、任五等人在云南起义失败后，逃到陕西，“潜于礼拜寺造成军械旗帜”，各地回民“皆听命焉”。在陕西回民起义军十八大营的主要领导人当中，赫明堂、邹玉龙、马均福、毕大才、阎兴春、陈林、关阿訇、郭二阿訇、二河洲阿訇等，都是主持教务于一方的阿訇。他们以自己的特殊身份，振臂一呼，应者云集，起了战斗组织者的作用。所谓十八大营，也正是在各地清真寺联合的基础一形成的回民起义大军。抗日解放战争中，回民支队的各层领导者也经常在就近的清真寺中开会商议军情，做战略部署。

    清真寺在某些地区还是穆斯林群众欢度斋月的筵宴场所。穆斯林在斋月期间，每天的开斋饭由当地的高目轮流作东，遍请本坊教胞自由到寺开斋，女宾也另辟一室参加。请众到寺开斋的主家，由家庭主妇率子女亲下厨房烹调，并以此为荣。如果有某家先人曾以土地房产捐赠给寺为公产者，则寺众例须为这“施主”之家代作东道，择选一日，专请当地教胞到寺开斋，所花费用全由寺中公积金开支，亡人族则全部到寺，作名义上的主人，招待所有来宾。

    总之，中国清真寺的社会职能是多方面的，它既是穆斯林进行宗教活动的中心场所，更是穆斯林的进行政治、经济、文化、教育、体育、生活等一切社会活动的中心场所。与阿拉伯国家那种专作礼拜用的“麦斯吉德”相比，社会职能的多样化正是中国清真寺的一特点。