1、藏区6大宁玛派寺庙中，甘孜州就占4座：白玉的嘎拖寺、白玉寺、德格竹庆寺、协庆寺（西藏为多吉扎、敏珠林寺）。其中嘎拖寺建寺最早，有900余年历史，以竹庆寺最享有盛名，该寺“协日升”成为宁玛派显密教法的最高学府。

      2、噶举派：八邦寺最为著名，其声望仅次于西藏楚布寺。辖印经院、佛学院各1所，静修院3所，有权卜算，认定噶举各寺庙转世活佛。康区该派寺庙要取得喇嘛称号，必须经八邦寺考核或修法三年三月零三天；若上西藏楚布寺学法或深造，也须在八邦寺获得“签证”。此外，康定贡嘎寺也是著名噶举派寺庙。

       3、萨迦派：以更庆寺、高尔寺、日库寺、塔公寺等最为著名。

       4、格鲁派：理塘长青春科尔寺为三世达赖索南嘉措所建，是康区第一座格鲁派寺庙，有“上有拉萨三大寺，下有发多塔尔寺，中有理塘长青春科尔寺”之说。此外，霍尔十三寺、道孚惠远寺、巴塘康宁寺、稻城雄登寺、乡城桑坡寺等在藏区享有一定名声。在历史上，州内还曾诞生过第七、第十、第十一世3位达赖喇嘛。